科学是建立在可检验的解释和对客观事物的形式、组织等进行预测的有序知识系统，是已经系统化和公式化了的知识。所谓玄学就是科学还未系统化公式化了的知识，因为没有系统化公式化，所以表现得特别神秘，但不是说有神秘力量（鬼神）存在，不加考证的相信就是迷信。
一、世界是客观的，物质的，人类的认知是有限的，认知水平不断提高。
人类经过漫长的进化从动物界中脱颖而出，中国发现最早的古人类元谋人距今约170万年，发展到北京人、山顶洞人、河姆渡人经过了几百万年的漫长进化，人类逐渐走入文明。然后三皇五帝到如今，真正有文字记载的文明不过五千年。然而科技的飞跃发展是欧洲文艺复兴之后。相比人类历史只有短短五六百年的时间。所以，人类所掌握的知识是有限的。《庄子·内篇·养生主第三》：“吾生也有涯，而知也无涯。以有涯随无涯，殆已！”庄子这么博学的人都感慨“以有涯随无涯，殆已！”。
人类所掌握的知识有限，属于局部真理，目前认为正确的，随着认知的发展或许证明是错误的，现在不可能的事情，或许将来是可行的。现在大部分人都认可地球绕着太阳转了吧，然而目前看似非常简单的道理，却是经过几百年的科学发展。我国古代认为天圆地方，欧洲盛行地心说。最初由古希腊学者欧多克斯（提出“同心球”模型）提出，后经亚里士多德、托勒密进一步发展而逐渐建立和完善起来。我们叫中国，其实也有世界中心之意。哥白尼经过多年研究提出日心说，生前都不敢宣传，布鲁诺捍卫日心说被宗教烧死在鲜花广场。后来伽利略发明了望远镜，通过观测发现了一些地心说的错误。之后又经过第谷几十年的数据观测，后又经其学生开普勒数据分析发现了行星运动三大定律。这也不是终极理论，又过了若干年经过牛顿的研究，提出万有引力。行星的运动规律才变清晰。然而这也不是终极理论，爱因斯坦又提出广义相对论。相对论也不可能是终极理论，还会继续发展。
人类的认知水平逐渐的提高，然而“人类认知水平”仅代表人类的最高水平，却不是平均水平。大部分人的认知还处在相当低的水平，周围还有不少人搞不清楚地球是圆是方。
二、一部分玄学是暂时还未系统化量化的科学
科学发现是非常漫长的过程。如上面的例子，行星运行规律经过了几百年的研究才算搞清楚。科学对待未知问题不懈努力，甚至几代人前赴后继的努力，观测、实验、分析、归纳、验证、检验、修正，再检验，再修正，直到尽善尽美。
从经验得出的粗略结论，并且没有系统的、量化的理论做支持，所以难以精确的解释给其他人，于是就被认为非常神秘。有人称中医是玄学，其义是“伪科学”。这是不对的，中医历史悠久，受当时技术水平限制，大多没有像西医那样清楚。按照西医（西医自诩是科学）的理论很多药方，成分未知，甚至有些成分具有毒性。针灸讲究经络穴位，但是按照西医解剖学并未达成一致结论。目前没有统一结论，不代表以后没有，只是暂时没有而已。另外中医不是就保持现状停滞不前了，现代中医也完全可以采取现代科技手段。例如，青蒿素就是从中医中通过科学手段挖掘出来的。
三、有些玄学则是故弄玄虚以此牟利
故弄玄虚之玄学好比魔术，魔术也是科学的，充分利用了心理学、障眼法等等手段来迷惑观众。但是只有表演者掌握了其中原理，为了达到牟利目的，而不愿意和大家分享，并冠以魔的名字，“魔”和“玄”其实异曲同工。曾经静电现象也被用于魔术表演，只是大多数人理解其中原理后，就不再称之为魔术了。
史书有记载的陈胜吴广起义就利用大家相信鬼神来制造舆论宣传“大楚兴，陈胜王”。其实陈胜吴广肯定直到鬼神不存在，但是他们知道有大部分人相信鬼神存在。他们就利用了这一点制造舆论。史书上还有不少关于童谣应验的记载，有些是当时编出来制造舆论的。
四、迷信让玄学越来越玄
正如诺贝尔奖物理学奖章上面的图案，女神伊希斯从云中浮现，圣母握着象征财富和科学智慧的号角，轻轻拉开女神的面纱，露出她冷峻的面容，象征人类文明的不断进步和发展。是的，科学揭开的是冷峻的面容，没揭开之前是玄学，揭开后就是科学。科学往往是冷冰冰的，缺乏文学效果，不那么吸引人，并且需要大量的数学、物理知识储备，因此这个过程非常枯燥。而大部分人缺乏怀疑精神和探究能力，或者懒得去考证，选择盲目相信，于是就成了迷信。迷信在传播过程中又经过夸大和文学虚构，越传越神，越传越玄。例如推背图，都是后人事后附会的。
农村求雨、叫魂、撞鬼的传闻不少。笔者儿时就曾经历过求雨的活动，几个童男童女挨家挨户挖垄沟（院子的排水沟），一周内也没有下雨。求雨是否有效，取决于隔多长时间下的雨才算是求来的？过上十天半月下雨还能算是求来的吗？
叫魂一般是发生在婴幼儿或者身体非常虚弱的成年人身上。说是吓掉了魂，然后采取一些古怪的活动把魂给找回来了。我没有亲见，也许真的“管用”了。并这并不是真的丢了魂，也不是找回了魂。正常人大概经历过遇到可怕的东西，心脏砰砰跳的厉害，久久难以平静。婴幼儿和身体虚弱者更甚。这就是所谓的“掉魂”。叫魂的活动通常比较古怪，吸引了受惊吓者的注意力，注意力转移了，情绪得到缓和。其本质是转移注意力，而不是叫魂。说白了其实是蒙对了，因为是蒙对的，所以师徒传承上会有些走样，或者因为情况不同，所以时灵时不灵。
